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概要
高速分子シミュレーション研究チーム
分子動力学シミュレーション専用計算機MDGRAPE-3の開発とそのタンパク質科学への応用を進めています。MDGRAPE-3は2006年に完成した、世界初のペタフロップス(1000兆演算/秒)のピーク性能を持つ計算機です。この研究・開発は文部科学省の委託研究「タンパク3000プロジェクト」の支援を受けました。
システム計算生物学研究グループ

生命体基盤ソフトウェア開発・高度化チーム
次世代スーパーコンピュータを最大限活用したペタスケールのシミュレーションを実現するため、ソフトウェアの開発・高速化に取り組んでいます。
次世代計算科学研究開発プログラム
MDGRAPE-3
MDGRAPE-3は分子動力学シミュレーションに特化した専用計算機です。2006年に完成し目標性能の1ペタフロップス(1015演算/秒)を達成しました。この性能は当時世界最速であったBlueGene/Lの3倍で、専用化によりコストを抑えています。 詳細
生命科学への応用
分子動力学専用計算機を使ったシミュレーションの生命科学への応用を進めています。MDGRAPEの高性能を活かし、大規模なシミュレーションによる巨大生体分子の機能解析や、創薬のための大規模な高精度スクリーニングを目指して研究を進めています。 詳細
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